itis pozzuoli "guido tassinari" Dipartimento di Chimica

Indice programmi

Avogadro è un editor avanzato molecolare progettato per utilizzo cross-platform in chimica computazionale, modellistica molecolare, bioinformatica, scienza dei materiali, e in ambiti connessi. Offre rendering flessibile e un'architettura plug potente.

Il programma è corredato di un ottimo tutorial e con la funzione traslate di google si ha anche la traduzione.

Tutorial : Come iniziare

Apertura di file , la navigazione, impostazioni di rendering

Tutorial : disegno di molecole

Disegno, aggiunta / rimozione di atomi di idrogeno , ottimizzazione della geometria

Esercitazioni : le selezioni

Elimina, copia / incolla , opera sulle selezioni

Esercitazioni : tipi di visualizzazione

La selezione , che, in configurazione di come le molecole vengono visualizzati

Tutorial : Modifica la geometria

Cambiare lunghezza di legame , angoli

Tutorial : Orbitali

Visualizzazione con programmi di chimica quantistica

Tutorial : Inserire SMILES

Disegnare le strutture con una stringa SMILES

Tutorial : Inserire un peptide

Disegno e montaggio di strutture di peptidi

Lavorare con i cristalli
Avogadro 1.1 consente di disegnare, regolare il volume o la spaziatura di una cella unitaria.
- Esercitazioni : Meccanica molecolare
AutoOptimize , ottimizzare la geometria
- Tutorial : campi di forza campi
campo di forza , consigli, ecc
- Utilizzo dei vincoli
  Avogadro consente l'ottimizzazione di un oggetto, rispetto a una o più variabili,
  - Tutorial : Console
  Manipolazione delle molecole in Avogadro , utilizzando la console di Python

http://avogadro.cc/

I T I S "Guido Tassinari "

dipartimento di chimica

nel rispetto dell'ambiente

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